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識病尋源|從基因編輯技術(shù)CRISPR治療失敗看杜氏肌營養(yǎng)不良癥

楊云龍/復旦大學基礎(chǔ)醫(yī)學院細胞與遺傳醫(yī)學系研究員
2022-11-24 16:11
來源:澎湃新聞
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【編者按】2022年10月,全球唯一一名參與CRISPR基因編輯療法的杜氏肌營養(yǎng)不良癥(DMD)志愿者,在治療過程中死亡。復旦大學基礎(chǔ)醫(yī)學院細胞與遺傳醫(yī)學系研究員楊云龍表示:CRISPR相關(guān)技術(shù)作為一種高效且廣泛應用的基因編輯方法,是當前研究的熱點。將其應用于臨床,由于涉及到倫理和監(jiān)管問題,也常常成為爭議的焦點。他希望更關(guān)注DMD這一遺傳性罕見病本身,DMD目前還沒有治愈方法?!白R病尋源”是楊云龍在澎湃科技開設(shè)的獨家專欄。

2022年11月10日,《科學》雜志(Science)的新聞欄刊登了一條信息[1]:一名27歲杜氏肌營養(yǎng)不良癥患者在一項新型基因編輯試驗中死亡。雖然信息披露尚不充分,但許多科學家認為,這名患者確實通過病毒輸注,接受了基于CRISPR的治療。

根據(jù)ClinicalTrials.gov上的注冊信息(NCT05514249),該臨床試驗僅有一名參與者。受試者2022年8月底在美國馬薩諸塞大學醫(yī)學院接受了靜脈輸注,約6周后去世。CRISPR相關(guān)技術(shù)作為一種高效且廣泛應用的基因編輯方法,是當前研究的熱點。將其應用于臨床,由于涉及到倫理和監(jiān)管問題,也常常成為爭議的焦點。由于基因編輯的話題性,大量的新聞網(wǎng)站報道了該事件。但新聞報道中并未對受試者患有的杜氏肌營養(yǎng)不良癥作詳盡解釋。例如,在美國廣播公司(American Broadcasting Company, ABC)的報道中,僅有一句話描述該?。骸斑@種罕見的遺傳性肌肉萎縮疾病是由產(chǎn)生一種叫做肌營養(yǎng)不良蛋白的基因突變引起”。

杜氏肌營養(yǎng)不良癥(Duchenne Muscular Dystrophy, DMD)得名于紀堯姆·本杰明·阿曼德·杜興(Guillaume Benjamin Amand Duchenne, 1806-1875)。他是200年前的法國神經(jīng)生物學家,進行了肌肉電刺激的開創(chuàng)性研究。杜興不僅嘗試用電治療肌肉問題,還將電作為研究解剖結(jié)構(gòu)和生理學的研究手段。他發(fā)明了“杜興機”—一種用電刺激肌肉的便攜裝置,極大地豐富了電生理學研究。使用該裝置,他發(fā)現(xiàn)假笑不涉及眼睛周圍的肌肉,而發(fā)自內(nèi)心的微笑涉及眼周和嘴部肌肉。如今,這種需要調(diào)動眼輪匝肌的真誠笑容被稱為“杜興笑”。實驗過程中拍攝的電刺激面部肌肉的照片令人印象深刻,廣為傳播。部分原始照片現(xiàn)已被收入美國紐約的現(xiàn)代藝術(shù)博物館(Museum of Modern Art, MoMA)

杜興用電刺激受試者面部肌肉的照片,1856。來源:MoMA館藏。

1842年起,杜興在巴黎開展肌營養(yǎng)不良和其他神經(jīng)肌肉疾病的研究,嘗試用電刺激觸發(fā)特定肌肉運動,并詳細描述了幾類神經(jīng)肌肉疾病。在杜興之前,DMD的病例已經(jīng)被零星地描述過,如1830年,英國著名醫(yī)生查爾斯·貝爾(Charles Bell, 1774-1842)描述了一名肌肉進行性麻痹導致下肢癱瘓的18歲男子,從10歲起大腿無力,不能站立[2]。1847年理查德·帕特里奇(Richard Partridge,1805–1873)第一次對DMD患者進行病理尸檢,發(fā)現(xiàn)“肌肉出現(xiàn)脂肪變性,小腿變性程度高于上肢,神經(jīng)和肌腱都沒有發(fā)生變化”[3]。1851年,愛德華·梅里恩(Edward Meryon,1807–1880)首次對DMD進行了明確的臨床和病理描述,他向倫敦皇家醫(yī)學和外科學會提交了論文,描述患者尸檢結(jié)果:“在顯微鏡下檢查肌肉組織時,發(fā)現(xiàn)條紋狀纖維被完全破壞,肌節(jié)成分彌散,在許多地方轉(zhuǎn)化為脂滴和顆粒物,肌纖維膜被破壞”[4]。梅里恩最初認為DMD患者是由于脊髓問題導致,但經(jīng)過仔細檢查,他發(fā)現(xiàn)患者神經(jīng)組織是完整的,觀察到的唯一結(jié)構(gòu)變化是肌纖維改變,脂肪填充了肌肉纖維鞘。從1851年到1870年,梅里恩一直對這一疾病開展研究,可能是全面總結(jié)DMD的第一人。杜興則首次拍攝了DMD患者的照片,1862年發(fā)表在照片集《病理攝影集》(Album de photographes pathologiques)中[5],這也是首次出版的臨床影像資料的書籍。更進一步,杜興發(fā)明了一種肌肉活檢針,于1864年應用,對一名DMD患者肌肉進行了活檢觀察。杜興高質(zhì)量地確定了DMD的關(guān)鍵病理結(jié)果,并在1868年總結(jié)了該病的特征。隨后,神經(jīng)科學家威廉·理查德·高爾斯爵士(Sir William Richard Gowers,1845–1915)在觀察了多個家系后得出結(jié)論,DMD是一種具有明顯男性偏好的早發(fā)性遺傳疾病,其病因來自卵子。大多數(shù)病例6歲前發(fā)病,由于腿部肌肉乏力,具有特征性的站起姿勢。高爾斯嘗試過多種療法,包括杜興的電刺激療法,未觀察到療效[6]。在確定DMD的疾病特征、病理改變的過程中,杜興、高爾斯等人做出了大量的貢獻。2003年,《神經(jīng)病學年鑒》(Annals of Neurology)期刊主編Kenneth Tyler教授對DMD的早期探索歷史進行了總結(jié),并在美國神經(jīng)病學年會上報告[7]。

杜興為他第一位DMD患者拍攝的影像資料。來源:[4]

進入20世紀,DMD研究一度陷入沉寂。直到進入分子時代,大量的遺傳學研究和分子生物學研究聚焦于該疾病,極大地豐富了我們對DMD的認知。通過流行病學調(diào)查,我們知道杜氏肌營養(yǎng)不良(DMD)是一種X連鎖隱性遺傳病,發(fā)病率在男性嬰兒中約十萬分之10,屬于發(fā)病率較高的遺傳病。另一類稱為貝氏肌營養(yǎng)不良(Becker muscular dystrophy, BMD)與其發(fā)病機理類似,發(fā)病率為約十萬分之8。它們在女性中極為罕見。

究其病因,DMD和BMD是由肌細胞中一個重要蛋白Dystrophin遺傳改變,導致結(jié)構(gòu)及功能缺失所致。編碼蛋白的基因體量巨大,是人類基因組中最大的基因之一。具有79個外顯子,翻譯出的蛋白質(zhì)量有427kDa。Dystrophin通過兩端的結(jié)構(gòu)域?qū)⒓毎羌艿鞍譌-actin與細胞外基質(zhì)連接起來。此外,Dystrophin還結(jié)合肌膜、細胞骨架、通道蛋白以及信號蛋白,形成復雜的復合物,并介導一系列功能。目前對這些功能的理解還不充分。在DMD患者中,Dystrophin被截斷,導致細胞骨架無法連接到細胞外基質(zhì)。在BMD中,Dystrophin的關(guān)鍵結(jié)構(gòu)域尚存,但結(jié)構(gòu)不完整,所以病情較輕。遺傳突變是導致Dystrophin丟失或損傷的直接原因。迄今,已在DMD和BMD患者中發(fā)現(xiàn)了數(shù)千種不同類型的突變。大多數(shù)的突變發(fā)生在熱點區(qū)域,即3號-9號外顯子以及45號-55號外顯子區(qū)域。

Dystrophin可以和多種蛋白結(jié)合,其缺失廣泛影響肌細胞功能。來源:[8]

Dystrophin發(fā)生問題后,以其為中心的復合物會解體,肌細胞結(jié)構(gòu)完整性、肌肉收縮能力、肌細胞的信號傳導都會受到影響。體現(xiàn)在肌細胞上,就是肌膜易受收縮損傷、細胞被自由基損傷、鈣離子超載、再生受阻等。這些受損的肌細胞會被炎癥細胞識別并清除。在疾病早期,受損肌肉尚可通過再生修復。但在晚期,由于再生能力降低和纖維化信號上調(diào),肌細胞被脂肪組織和纖維化組織取代,進而影響患者運動能力。

DMD目前沒有治愈方法,但合理治療可緩解疾病進展,減輕患者負擔。在疾病診斷方面,若發(fā)現(xiàn)男孩有癥狀,要對患者家庭開展基因咨詢,協(xié)助診斷。這有助于分型并指導未來治療。在治療方面,目前的標準方案是:DMD患兒在其運動發(fā)育停止時(一般在4-5歲)使用糖皮質(zhì)激素,并在整個生命周期內(nèi)持續(xù)治療,這主要是由于糖皮質(zhì)激素可促進肌細胞增殖同時抑制炎癥。該療法可延緩病情,增進患者生存。同時,對癥的多學科治療和高質(zhì)量的護理也可改善生活質(zhì)量和壽命。這包括醫(yī)師、護士、康復師、營養(yǎng)師、心理醫(yī)生等的共同合作。對于DMD的診療方案,2018年發(fā)表于Lancet Neurology的指南做了最為完善的總結(jié) [9-11]。

由于DMD的不可治愈,在科研領(lǐng)域,科學家仍在不斷尋找肌營養(yǎng)不良的療法,確認Dystrophin缺失是病因后,一個樸素的“治本”的想法就是能否令肌細胞重新表達這一蛋白。由于編碼蛋白的基因體量過大,直接導入全長基因并不現(xiàn)實。于是科學家們開發(fā)了一系列新療法,主要包括基因療法和細胞療法。具體可分為以下幾類:

終止密碼子通讀:有5%-7%的DMD病例,是由于基因突變形成了終止密碼子,也就是無義突變。該突變導致Dystrophin合成提前終止。若能強制要求蛋白繼續(xù)合成,就可能得到一個全長的蛋白,從而治療疾病。一種小分子藥物Ataluren可以誘導核糖體在遇到無義突變時繼續(xù)向下翻譯。在臨床試驗中,該藥物未能達到主要終點,但顯示了一定的治療趨勢,且安全性良好。因此得到了歐洲藥監(jiān)局的條件性使用批準。

外顯子跳躍:蛋白表達需要先轉(zhuǎn)錄為mRNA,通過剪接將多個外顯子拼在一起。某些特定的突變可導致蛋白合成提前終止。若能跳過該突變所在的外顯子區(qū)域,產(chǎn)生一個不是全長的蛋白。雖然仍不及健康蛋白,但可顯著減輕病情。這一方法利用寡核苷酸片段改變剪接過程,體積小,易于遞送,安全性好。該方法針對不同突變要設(shè)計不同的寡核苷酸藥物,目前的藥物針對突變最多的群體,如外顯子44、45、51、53等,需要重復治療。其中部分藥物已獲美國藥監(jiān)局的條件性使用批準。

表達微型蛋白:使用腺相關(guān)病毒(Adeno-associated virus, AAV)可遞送cDNA,令感染的組織表達特定蛋白。該方法也是其他基因療法中常見方案。但在DMD中,由于AAV容量有限,無法運載編碼Dystrophin的載體。于是科學家提出了僅將最關(guān)鍵結(jié)構(gòu)域重組為微型蛋白,再用AAV導入的方法。臨床試驗結(jié)果證實,微型蛋白在受試者肌細胞中成功表達,但目前還不知道對疾病的改善情況。需要注意的是,AAV可能導致患者出現(xiàn)嚴重的免疫反應。即使對患者進行了預篩選和免疫抑制,仍有患者出現(xiàn)了嚴重不良事件。 2021年12月,輝瑞公司在一例受試者報告死亡后,暫停臨床試驗,目前正在恢復中。

基因組編輯技術(shù):如果能夠?qū)蚪M直接進行靶向修飾,糾正突變,或者將導致蛋白丟失的突變刪除或替換,是非常有吸引力的方法。通過設(shè)計引導RNA,引入CRISPR系統(tǒng),可以做到在基因組特定位點刪除外顯子、取消剪接位點等。該方法在動物實驗中已獲成功。但由于基因編輯的脫靶風險和對其中的蛋白或病毒載體產(chǎn)生免疫反應的風險,基因組編輯尚未進入臨床。開篇提及的新聞報道中,死亡的患者可能參加了這一療法的臨床研究。

干細胞移植:將帶有正?;虻母杉毎浦玻迯图∪?。雖然該方法有吸引力,但肌肉組織的體量對該方法提出了挑戰(zhàn)。臨床試驗也發(fā)現(xiàn),僅在局部注射的位置旁有一些恢復。該方法目前未獲批準。

類似蛋白替代:Dystrophin有一種類似蛋白稱為Utrophin,若上調(diào)其表達可產(chǎn)生一定的代償效應。有臨床試驗研究了能夠上調(diào)Utrophin的藥物,但未觀察到治療效果。

除了這些“治本”的療法,還有許多藥理學藥物在臨床試驗中,或可通過減少纖維化、減輕炎癥,擴張血管、保護線粒體功能、靶向肌肉調(diào)節(jié)蛋白等不同機制,可能緩解病情[12]。

從患者的角度看來,多種療法帶來了治愈疾病的希望,但治療方案與患者的適配性仍有待考量,且方法之間可能互斥。綜合比較,表達微型蛋白是一種普適的方法,但其仍存在安全隱患。其不良反應可能主要由AAV介導,涉及制造過程中的諸多因素,如劑量、AAV類型、轉(zhuǎn)入的載體、患者是否已有抗體等。開篇提到的新聞報道中,患者應該是選擇了基于CRISPR的基因組編輯技術(shù)。報道體現(xiàn)了公眾對以CRISPR為代表的基因療法的擔憂。在該試驗更多信息披露之前,更重要的可能是提高公眾對疾病和各類療法的深入理解。更進一步,患者和患者家屬通過理解相關(guān)研究,決定治療方案,決定是否參與前沿療法的臨床研究,需要勇氣、知識、智慧和積極的人生觀。而對于患有DMD這樣的罕見病患者,在某種程度上,積極的人生觀要比新穎的療法更為重要。

(作者楊云龍,系復旦大學基礎(chǔ)醫(yī)學院細胞與遺傳醫(yī)學系研究員、副主任。疾病不斷地改變著每個人的人生軌跡。但除了醫(yī)生與醫(yī)學研究者,人們很少有機會了解各式各樣的疾病?!白R病尋源”專欄將以一文一病的形式,介紹對疾病的認識進程,疾病的病因及其治療。跟隨醫(yī)學科學的進步,理解現(xiàn)代醫(yī)學。)

參考文獻

1.      https://www.science.org/content/article/news-glance-new-antibiotic-covid-19-antarctica-and-venus-mission-deferred. doi: 10.1126/science.adf7363

2.      Bell, C., The nervous system of the human body : embracing the papers delivered to the Royal Society on the subject of the nerves. 1830, London: Longman, Rees, Orme, Brown, and Green. xxiii, 238, clxxvi p., 9 leaves of plates.

3.      Patridge R. Fatty degeneration of muscle. Med Times Gaz 1847; 5: 944.)

4.      Meryon, E., On Granular and Fatty Degeneration of the Voluntary Muscles. Med Chir Trans, 1852. 35: p. 73-84 1.

5.      Duchenne GBA. Album de photographes pathologiques. Paris: Bailliere; 1862.

6.      Gowers WR. Clinical lecture on pseudo-hypertrophic muscular paralysis. Lancet 1879; 2: 1–2, 37–39, 73–75, 113–116.

7.      Tyler, K.L., Origins and early descriptions of "Duchenne muscular dystrophy". Muscle Nerve, 2003. 28(4): p. 402-22.

8.      Duan, D., et al., Duchenne muscular dystrophy. Nat Rev Dis Primers, 2021. 7(1): p. 13.

9.      Birnkrant, D.J., et al., Diagnosis and management of Duchenne muscular dystrophy, part 1: diagnosis, and neuromuscular, rehabilitation, endocrine, and gastrointestinal and nutritional management. Lancet Neurol, 2018. 17(3): p. 251-267.

10.   Birnkrant, D.J., et al., Diagnosis and management of Duchenne muscular dystrophy, part 2: respiratory, cardiac, bone health, and orthopaedic management. Lancet Neurol, 2018. 17(4): p. 347-361.

11.   Birnkrant, D.J., et al., Diagnosis and management of Duchenne muscular dystrophy, part 3: primary care, emergency management, psychosocial care, and transitions of care across the lifespan. Lancet Neurol, 2018. 17(5): p. 445-455.

12.   Markati, T., et al., Emerging therapies for Duchenne muscular dystrophy. Lancet Neurol, 2022. 21(9): p. 814-829.

    責任編輯:曹年潤
    圖片編輯:蔣立冬
    校對:張艷
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